La bóveda de crucería de gran altura que cubre el ábside y la capilla lateral, así como los arranques de la bóveda de la nave central, muestran que este templo estaba proyectado en estilo gótico. Pero, tal vez por falta de fondos, se remató con un artesonado mudéjar.

Destacan en el interior el retablo mayor, de estilo renacentista, con la talla de María Magdalena en el centro, rodeada por cinco pinturas de la vida de la Magdalena y el Calvario de Cristo.